W ostatnim czasie najbardziej poszukiwaną substancją jest szczepionka na koronawirusa. Do badań i testów przystąpiło wiele organizacji i firm, w tym także Microsoft, który rozszerzył właśnie partnerstwo z Adaptive Biotechnologies. Celem tej współpracy będzie zmapowanie odpowiedzi immunologicznych osób, których organizmy pokonały infekcję. Do czego posłużą te dane i w jaki sposób zostaną zebrane?
Odpowiedź immunologiczna (odpornościowa) to całokształt zmian, jakie zachodzą w organizmie pod wpływem kontaktu z antygenem. W przypadku osób, które zostały wyleczone, sygnatura takiej odpowiedzi może przysłużyć się do rozwoju metod diagnozowania, leczenia i zapobiegania zakażeniom koronawirusem. Dane pozyskane przez Microsoft i Adaptive Biotechnologies zostaną udostępnione za darmo wszystkim badaczom, urzędnikom publicznej służby zdrowia i organizacjom za pośrednictwem specjalnego portalu. Działania partnerów mają przebiegać w następujący sposób:
- Adaptive Biotechnologies rozpocznie w kwietniu pobieranie zanonimizowanych próbek krwi, używając zgodnej z LabCorp, mobilnej usługi badania krwi. Próbki pochodzić będą od osób zdiagnozowanych lub wyleczonych z COVID-19. Wirtualnymi testami klinicznymi zarządzać będzie Covance.
- Immunoreceptory komórek odpornościowych z tych próbek krwi będą sekwencjonowane z użyciem technologii platformy Illumina i mapowane pod kątem antygenów specyficznych dla SARS-CoV-2, które zostaną potwierdzone przez należącą do Adaptive platformę immunologiczną, aby spowodować reakcję (odpowiedź) immunologiczną.
- Sygnatura odpowiedzi immunologicznej na podstawie początkowych badań i próbek zostanie wgrana na portal danych z otwartym dostępem.
- Wykorzystując hiperskalowalne możliwości machine learningowe Microsoftu i platformę chmurową Azure, dokładność sygnatury odpowiedzi immunologicznej będzie stale poprawiana i aktualizowana w czasie rzeczywistym, gdy kolejne próbki będą sekwencjonowane.
Jak podkreśla Peter Lee, CVP AI and Research w Microsoft, rozwiązanie COVID-19 nie będzie pochodziło od jednej osoby, jednej firmy ani jednego kraju. Jest to globalny problem i to globalne starania go rozwiążą. Instytucje zainteresowane przesłaniem próbek krwi proszone są o kontakt pod adresem COVID19ImmuneResponse@adaptivebiotech.com.
